- Taxonomia Microbiana
A taxonomia de procariontes é baseada na taxonomia polifásica. O nosso trabalho mais recente, que analisou 32 genomas de diferentes espécies de vibrios, propoe uma nova taxonomia, a taxonomia genomica, baseada em Multilocus Sequence Analysis (MLSA), super-árvore, Average Amino Acid Identity (AAI), assinatura genômica e uso de códons para explorar as relações taxonômicas de linhagens, especies, e niveis taxonomicos mais altos. (Thompson et al. 2009 PMID: 19860885).
Estudos por meio de metodologias independentes de cultivo nos ajudam a melhor entender o papel da diversidade microbiana no meio marinho. Estudos recentes do nosso grupo determinaram a diversidade de bacterias associadas com corais saudaveis e doentes no Banco de Abrolhos (Alves et al., 2009; Chimetto et al., 2009; Reis et al., 2009). - Genética bacteriana e a interação bacteria-hospedeiro
Por meio das ferramentas da genética bacteriana e da proteômica, estamos estudando o papel de diferentes genes de virulência de vibrios e outras bactérias em corais. Estamos estabelecendo bioensaios com modelos animais (coral, mosca e artemia) e zooxantelas a fim de entender o processo de doenca causado por vibrios e outras bacterias em corais.
- Microbiologia aplicada
Detecção de contaminantes da bioindustria do Etanol. Busca por novas enzimas microbianas na Mata Atlântica.
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